Voici quelques titres de chansons entendus pendant les épisodes de NCIS.
| Episode | Titre de la chanson | Interprète | Scène |
| 5×02 Family | All We Are | Matt Nathanson | Fin de l'épisode quand Tony brûle la lettre de Jeanne |
| 5×03 Ex-File | Undone | Will Dailey | Début de l'épisode |
| 5×03 Ex-File | Bela Belisima (Beautiful, Very Beautiful) | HaDag Nachash | Chanson écoutée par Ziva en sortant de l'ascenseur |
| 5×03 Ex-File | The Elements | Tom Lehrer | Chanson des éléments, dans le labo d'Abby |
| 5×03 Ex-File | Hush, Little Baby (Chut, petit bébé) | — | Chanson jouée par Kelly sur le piano |
| 5×07 Requiem | The Kiss | Karmina | Sur la page MySpace de Maddie |
| 5×07 Requiem | All I Need | Mat Kearney | Dans l'appartement de Maddie quand elle est avec Gibbs |
| 5×07 Requiem | Big River | Johnny Cash | Sur l'enregistrement quand l'équipe recherche Hass |
| 5×07 Requiem | Hush, Little Baby (Chut, petit bébé) | Bobby McFerrin, Yo Yo Ma | Fashback de Gibbs quand il chantait cette berceuse à Kelly |
| 5×07 Requiem | Major Tom | David Bowie (Space Oddity) | McGee et Tony devant l'écran plasma |
| 5×11 Tribes | Courting Dementia | Dominic Kelly | La première fois où Gibbs entre dans le labo d'Abby (15:19) |
| 5×11 Tribes | The Last Firstborn | Celldweller | La seconde fois où Gibbs entre dans le labo d'Abby (27:35) |
| 5×16 Recoil | Where I Stood | Missy Higgins | Ziva entre dans le bar et donne à Michael, le numéro de Devon (42:11) |
| 5×18 Judgement Day | I Get Around | Beach Boys | Ziva et Tony font un tour en voiture en direction de Los Angeles…Mais ils sont vite bloqués par le traffic important… (15:01) |
| Episode | Titre de la chanson | Interprète | Scène |
| 4.01 Shalom | Mas | Kinky | Chanson écoutée par Ziva dans sa voiture |
| 4.07 Sandblast | Like A Star | Corinne Bailey Rae | Musique d'ambiance du bar où Tony se trouve avec Jeanne |
| 4.10 Smoked | Trouble Sleeping | Corinne Bailey Rae | Dans l'appartement de Jeanne, quand Tony frappe à sa porte |
| 4.12 Suspicion | Dueling Banjoes | film “Deliverance” | Chanson interprétée à leur manière par Tony et Tim |
| 4.18 Iceman | It's Only Memories | PJ Olsson | Musique de fond quand Tony est dans l'appartement de Jeanne |
| 4.19 Grace Period | Everybody Hurts | R.E.M | Fin de l'épisode quand Tony dit à Jeanne qu'il l'aime |
| 4.24 Angel of Death | Makes Me Wonder | Maroon 5 | Musique d'ambiance du bar |
| Episode | Titre de la chanson | Interprète | Scène |
| 3×06 The Voyeur's Web | Ohh La La | Goldfrapp | Début de l'épisode |
| 3×08 Under Covers | Closer - Got it | Goapele | Tony et Ziva dans la chambre d'hôtel |
| 3×16 Family Secrets | Name of the Game | Crystal Method | Scène de Basketball |
| 3×17 Ravenous | Your Man | Josh Turner | Tony et Ziva entrant dans le bar |
| 3×17 Ravenous | Evil Night Together | Jill Tracy | Abby ouvrant son cadeau |
| 3×18 Bait | Lights Out | P.O.D | Début de l'épisode |
| 3×21 Bloodbath | Over My Head (Cable Car) | The Fray | Abby et McGee dans l'appartement de McGee |
| 3×21 Bloodbath | American Witch | Rob Zombie | Dans les bureaux de “Krime Kleaners” |
| Episode | Titre de la chanson | Interprète | Scène |
| 2×06 Terminal Leave | Outrageous | Britney Spears | Kate chantant sous la douche |
| 2×16 Pop Life | Toxic | Britney Spears | Scène du club |
| 2×20 Red Cell | Thème de Peter Gunn | Henri Mancini | Abby jouant avec le pistolet de paintball |
| Episode | Titre de la chanson | Interprète | Scène |
| 1×03 - Seadog | What I Like About You | The Romantics | Début de l'épisode, autour de feu |
| 1×05 - The Curse | Melting | The Newlydeads | Gibbs et Abby dans le labo (32”) |
| 1×07 - Sub Rosa | Euphoria | Collide | Tony et Abby dans le labo (38”) |
| 1×08 - Minimum Security | Abby's Dance | Numeriklab | Benjamin offrant du parfum à Abby dans le labo (11”) |